Для управления базами данных вам следует перейти на вашего пользователя (User Level) в раздел Mysql Management.
Для примера добавим новую базу данных, но тут есть несколько нюансов:
При создании базы данных нужно кое-что прояснить касательно пользователя баз данных. Можно для каждой базы создавать своего пользователя, но это неудобно тем что например в phpMyAdmin нужно будет логиниться под разных пользователей чтобы работать с разными базами. А если создать все базы на одном пользователе то в phpMyAdmin будут доступны все базы под одним пользователем что более удобно но менее безопасно. Для того чтобы создать несколько баз на одном пользователе нужно первый раз создать базу и с ним пользователя. Данные пользователя нужно запомнить и при создании новой базы указать уже существующего пользователя и действующий пароль и база будет создана на этом MySQL-пользователе. Но тут нужно быть аккуратным, если указать для существующего пользователя другой пароль, но панель присвоит новый пароль пользователю и тогда прийдется в конфигах движков менять пароль для пользователя баз данных на новый или возвращать пароль на старый в редактировании одной из баз на этом пользователе.